四川省农业科学院植物保护研究所创建于1937年，前身为“四川省农业改进所植物病虫防治场”，1973年正式成立。下设党政办公室、条件财务办公室、科技管理办公室3个职能部门；设病害研究中心、虫鼠害研究中心、抗性鉴定与评价中心、农药与杂草研究中心、生物防治研究中心、科技成果转化中心共6个科研中心和农业部西南作物有害生物综合治理重点实验室。

该所是四川专业从事作物病、虫、草、鼠、药研究的省级公益型科研单位，主要研究领域包括：针对农业生产实际，进行主要粮、油、果、蔬、茶等作物病虫草鼠等有害生物的灾变规律、预警技术及防治措施的研究；主要粮经作物品种抗病虫性鉴定评价及抗源筛选，病原菌变异监测；新农药生物测定及使用技术研究、大田药效测评；生物农药、复配农药的研制；农产品无公害生产技术及果蔬储藏保鲜等。